Цивилизация
С помощью Hi-C метагеномики, особого метода, позволяющего получать более полные и точные геномы бактерий, российские ученые из Института биологии гена РАН и других исследовательских центров составили «портреты» бактерий, которые обитают в кишечной флоре пациентов в реанимациях. Об этом «Газете.Ru» сообщили в Министерстве науки и высшего образования РФ.
Информация об этих бактериях важна, так как среди них потенциально могут быть те, которые повышают риск смерти.
В рамках эксперимента ученые проанализировали микробиомы двух тяжелобольных пациентов, пребывающих в реанимации. Из метагеномов — данных ДНК-секвенирования микробиома — ученые собрали несколько десятков геномов бактерий, которые затем исследовали на предмет их генного состава. Среди реконструированных – геномы таких бактерий, связанных с заболеваниями у человека, как клебсиелла, энтерококки и патогенные клостридии.
«Хотя выборка небольшая, примеры показательные – у обоих пациентов существенно обеднено кишечное сообщество, в кишечнике каждого были не сотни видов бактерий, как обычно у здорового человека, а порядка десятка. Наш подход позволил определить набор генов у каждой из этих бактерий, в том числе более точно отнести те или иные гены к конкретной бактерии. Знание генома позволяет лучше понять, насколько конкретный микроорганизм представляет опасность для здоровья человека со сниженным иммунитетом», — рассказал «Газете.Ru» Александр Тяхт, руководитель исследования, заведующий группой биоинформатики Института биологии гена РАН.
Исследователи рассчитывают, что дальнейшая работа в этой области даст возможность высокоточно управлять составом микробиома людей, которые находятся в тяжелом состоянии, что поможет им выжить.
Подробнее о том, как работает Hi-C метагеномика и для чего ее можно использовать — в материале «Газеты.Ru».