Два года назад коллектив микробиологов из Университета Восточной Англии, Тихоокеанской северо-западной национальной лаборатории (США) и Университета штата Пенсильвания впервые продемонстрировали молекулярный механизм, позволяющий анаэробным бактериям Shewanella oneidensis транспортировать электроны через клеточные мембраны во внешнюю среду, в качестве которой могут выступать окислы железа и марганца.
Трансмембранная транспортная цепь, при которой электроны сбрасываются не на кислород, а на окисленные минеральные соединения, является частью дыхательного механизма анаэробных бактерий, умеющих получать энергию в бескислородных или бедных кислородом средах.
skin: article/incut(default)
data:
{
"_essence": "test",
"id": "3499422",
"incutNum": 2,
"repl": "<2>:{{incut2()}}",
"uid": "_uid_3627233_i_2"
}
Эукариоты в процессе дыхания в качестве акцептора электронов используют в подавляющем числе случаев молекулярный кислород. Электротранспортная цепь расположена у них на внутренней мембране митохондрий, где молекулярный кислород присоединяет к себе по два электрона и два протона (полученных от разложения углеродсодержащих субстратов) и превращается в воду. Такой тип дыхания называется аэробным — с соответствующими поправками и усложнениями он используется и высшими организмами, включая нас с вами.
Бактерии, то есть прокариоты, в качестве акцептора электронов могут использовать связанный кислород в минеральных соединениях, демонстрируя, таким образом, анаэробный тип метаболизма. В этом случае «приемники» электронов
вынесены за пределы клетки и бактерии дышат связанным внешним кислородом, содержащимся в окислах, отчасти (в случае «железодышащих» бактерий) восстанавливая связанное в них железо.
skin: article/incut(default)
data:
{
"_essence": "test",
"id": "3329335",
"incutNum": 1,
"pic2": "/files3/233/3627233/fig2.jpg",
"picsrc": "Расположение электрон-проводящих гемокомплексов внутри молекулы MtrF: входной пятый гем расположен во втором пространственном домене, выходной десятый -- в четвертом домене. Красным цветом выделены отрицательно заряженные зоны белка (-0,5В), голубым -- положительно заряженные (+0,5В) // PNAS",
"repl": "<1>:{{incut1()}}",
"uid": "_uid_3627233_i_1"
}
Однако электрохимический сценарий этого процесса, то есть каким именно путем электроны поступают в электрон-проводящий белковый комплекс, мигрируют и выводятся наружу, оставался непонятным.
Чтобы описать этот сценарий микробиологам потребовалось три года.
Главной задачей было получить трехмерную модель гемопротеинового комплекса MtrF и связанных с ним белков в разрешении достаточном для понимания механизма его работы. В результате с помощью рентгеноструктурного анализа, использующего метод дифракции рентгеновских лучей на поверхности кристаллов, модель кристаллической структуры MtrF была получена. Ее описание содержится в итоговой статье, опубликованной в Proceedings of the National Academy of Sciences.
skin: article/incut(default)
data:
{
"_essence": "test",
"id": "3600913",
"incutNum": 3,
"repl": "<3>:{{incut3()}}",
"uid": "_uid_3627233_i_3"
}
В качестве входного гема, осуществляющего забор электронов из клетки, был выделен пятый гемокомплекс, находящийся на одной стороне белка MtrF во втором домене. Сброс же электронов во внешнюю среду осуществляется десятым гемом, расположенным с противоположной стороны MtrF в четвертом домене (см. иллюстрацию).
Замеренный поверхностный потенциал между двумя доменами составил -0,5В и +0,5В.
skin: article/incut(default)
data:
{
"_essence": "test",
"id": "2797719",
"incutNum": 4,
"repl": "<4>:{{incut4()}}",
"uid": "_uid_3627233_i_4"
}
До полноценной бактериальной батарейки такая конструкция, конечно, пока не дотягивает. Но характер и объем работ на следующие три года уже определен точно: поверхностные гемопротеиновые комплексы анаэробов, сбрасывающих «дыхательные» электроны во внешнюю среду, — ключевой элемент будущих устройств, генерирующих энергию с помощью бактерий.
