До тех пор пока лекарства от СПИДа не показывают нужной эффективности, а средство предотвратить передачу ВИЧ от больных к здоровым не найдено, бороться с «чумой XX века» приходится в том числе и эпидемиологическими методами. Учёным приходится выявлять группы риска, следить за течением эпидемии в разных странах и разбираться, где расположены основные «рассадники» заболевания и куда вирус распространяется из этих рассадников.
ВИЧ – вирус иммунодефицита человека, вызывающий вирусное заболевание – ВИЧ-инфекцию.
Синдром приобретённого иммунного дефицита (СПИД) – состояние, развивающееся на фоне ВИЧ-инфекции и характеризующееся падением числа CD4+ лимфоцитов, множественными оппортунистическими инфекциями и неинфекционными заболеваниями. По сути, СПИД является терминальной стадией ВИЧ-инфекции.
Однако современные методы филогенетики позволяют провести куда более точные исследования, а сама природа вируса ВИЧ делает его очень подходящим для применения метода. РНК-вирусы очень изменчивы, что, с одной стороны, затрудняет борьбу с ними, а с другой – позволяет легко проследить родственные связи между различными циркулирующими в человеческой популяции штаммами.
Более того, характерные темпы замены нуклеотидов в коде вируса измерены, так что помимо восстановления филогенетического древа вирусов можно статистически осмысленно оценить и временную протяжённость каждой ветви этого дерева. А по характеру распространенности различных штаммов на карте можно определить, в каком месте та или иная ветка проткнула карту мира.
skin: article/incut(default)
data:
{
"_essence": "test",
"click": "on",
"incutNum": 4,
"repl": "<4>:{{incut4()}}",
"src": "2632230",
"uid": "_uid_2988500_i_4"
}
Затем они исключили из выделенных фрагментов те, что считаются связанными с возникновением устойчивости к антиретровирусным препаратам: поскольку такая терапия широко распространена в Европе, учёт этих фрагментов мог значительно сместить результаты филогенетического восстановления в сторону от его наиболее вероятного «естественного» исхода. В итоге осталось около 700 маркеров-нуклеотидов, по которым учёные и попытались проследить историю миграции вируса по Европе.
Результаты работы опубликованы в Retrovirology и, наверное, не так удивительны (см. карту).
Основными «рассадниками» ВИЧ стали Греция, Испания, в меньшей степени Португалия и почему-то Сербия. Притом Греция – на первом месте.
Иначе говоря, страны, которые посещает огромное число туристов. Возвращаясь с отдыха, некоторые из них увозят домой и неприятные «подарки» в виде ВИЧ, которые затем распространяют в своей родной стране. Почему в этой же компании оказалась и Сербия, не вполне понятно; в статье не уточняется, считалось ли Косово частью страны при анализе, известно лишь, что в работе учитывались данные, собранные в период с 1996 по 2002 и с 2002 по 2004 годы.
skin: article/incut(default)
data:
{
"_essence": "test",
"click": "on",
"id": "2769439",
"incutNum": 2,
"repl": "<2>:{{incut2()}}",
"uid": "_uid_2988500_i_2"
}
Остальные страны – Великобритания, Германия, Дания, Израиль, Италия, Норвегия, Швейцария и Швеция – свободно обмениваются различными штаммами, являясь как источником, так и стоком для вирусной миграции. В этой же компании и Нидерланды, где непропорционально велико разнообразие вируса. Как отмечают Параскевис и его коллеги, это тоже объяснимо: либеральные законы Голландии привлекают сюда великое множество как наркоманов, так и мужчин-гомосексуалистов («Международное общественное движение ЛГБТ» признано экстремистским и террористическим, запрещено на территории РФ), которые давно считаются главными группами риска.
Совершенно особое положение на карте миграции ВИЧ-1B по Европе занимает Польша.
skin: article/incut(default)
data:
{
"_essence": "test",
"click": "on",
"id": "2987500",
"incutNum": 3,
"repl": "<3>:{{incut3()}}",
"uid": "_uid_2988500_i_3"
}
Учёные надеются, что их работа поможет в разработке новых общеевропейских мер по борьбе с распространением эпидемии. Поскольку характер миграции вируса очень хорошо отслеживает характер туристической и трудовой миграции, учёные рекомендуют правительствам обратить особое внимание на этот путь распространения заразы. В конце концов, крыльев у ВИЧ нет; перемещается он лишь вместе с заражённым человеком.