Вспышка атипичной пневмонии в Юго-Восточной Азии в 2003 году не на шутку перепугала человечество. Из 8000 пораженных вирусом SARS 900 человек умерли от острого респираторного синдрома. Как и в большинстве случаев, причину стали искать в дикой природе. Ведь Юго-Восточная Азия, хотя и уступает Африке по числу очагов неизученных и опасных инфекций, всё равно остается не самым лучшим местом для проведения отпуска, если вы боитесь встречи с неизвестными инфекциями.
Очаг нашли достаточно быстро: за несколько месяцев были уничтожены практически все пальмовые циветты — похожие на смесь кота с мишкой хищные зверьки семейства виверровых, у которых был обнаружен тот же штамм вируса. Принеся в жертву тысячи животных, китайцы искоренили заболевание, и в 2004 году не было зарегистрировано ни одного нового случая.
Ученые из Университета Огайо не обвиняют жителей КНР в излишней жестокости, но настаивают на исторической справедливости.
По результатам многолетней работы по построению филогенетического дерева SARS они считают, что человеческий штамм вируса зародился у летучих мышей.
более известен как атипичная пневмония или SARS. Первый случай этого заболевания был зафиксирован в ноябре 2002 г. в китайской провинции Гуандун. На данный момент известно, что возбудителем атипичной пневмонии является коронавирус ТОРС (SARS-CoV), новый вид коронавирусов. Уровень смертности от ТОРС — около 10 процентов.
Вначале власти КНР скрывали сообщения о вспышке новой инфекции, однако эпидемия быстро распространилась на соседние Гонконг и Вьетнам в конце февраля 2003 и далее на другие страны и континенты. Последний случай заболевания ТОРС был зафиксирован в июне 2003. Всего было отмечено 8437 случаев заболевания, из которых 813 закончились летальным исходом.
В России был выявлен только один случай заболевания ТОРС, заболевший Денис Сойников был помещён в больницу Благовещенска 8 мая и выписан 11 июня 2003 г.
Эпидемия атипичной пневмонии впервые возникла в провинции Гуандун, в Китае. В первом случае атипичной пневмонии, по сообщениям выходцами из сельской местности в Фошане, Гуандун в ноябре 2002 года, и первый пациент, фермер, был госпитализирован в первой Народной больнице Фошана. Фермер умер вскоре после этого, и причина его смерти не была определена точно, однако вскоре стало ясно, что фермер умер от очень серьёзного заболевания, представляющего угрозу для жизни.
Китайские правительственные должностные лица, решили не информировать Всемирную организацию здравоохрания о начале распространения данного заболевания до февраля 2003 года, ограничивая освещение средствами массовой информации обнаружение данного заболевания целях сохранения доверия общественности. КНР с тех пор неоднократно официально извинилась за сильную медлительность и не принятие мер по борьбе с эпидемией атипичной пневмонии.
Информация у китайских властей была запрошена 5 и 11 декабря 2002 года. Общемировому распространению известия о начале эпидемии помешали в некоторой степени обновления различных сетей по здравоохранению, однако, тем не менее, в начале 2003 года во всём мире было получено предупреждение о необходимости воздержаться от поездок в Южный Китай.
Немалый риск повторного появления нового заболевания заставил ученых заняться сравнительной геномикой — тщательным анализом последовательности нуклеиновых кислот более сотни доступных штаммов различных коронавирусов, благо длина генома относительно невелика.
Команда Яниса восстановила филогенетическое дерево SARS и его ближайших родственников, а также схему распространения вируса по планете.
Ученые обработали больше ста штаммов, полученных от людей, различных видов летучих мышей, циветт, енотов и свиней. Исходя из полученных данных, они считают, что у всех этих разновидностей вируса один общий предшественник. Полную интерактивную карту можно посмотреть здесь.
Трагизм этой истории в том, что циветтам вирус передался от человека, за что потом безвинно пострадали от него же. Люди же получили вирус от летучих мышей, а кроме циветт «поделились» подарком природы ещё и со свиньями.
Но в уничтожении тысяч циветт и родственных им мусангов всё-таки был смысл. Во-первых, циветты и свиньи сформировали новый очаг инфекции, которая в любой момент могла бы передаться людям снова, что и было доказано командой Яниса. Ученые обнаружили, что некоторые из полученных от пациентов штаммов до этого принадлежали свиньям.
Кроме того, нахождение вируса в организме других животных неминуемо повлечет за собой большую изменчивость и, как следствие, большую опасность для человека.
Как именно вирус был передан от летучих мышей к человеку, пока остаётся неясным.
Исследование респираторных заболеваний у шимпанзе, живущих на Берегу слоновой кости в Африке, показало, что летальные случаи были вызваны вирусами, передавшимися от человека.
Ученые из институтов Роберта Коха и Макса Планка начали свою работу с демографического анализа популяции шимпанзе. Они обнаружили, что влияние соседства человека нельзя объяснить только конкуренцией, охотой или сокращением места обитания.
При этом пики смертности совпадали с вспышками ОРВИ у людей. Исследование тканей умерших животных подтвердило точку зрения ученых – в легких были обнаружены синцитиальный респираторный вирус человека HRSV и метапневмовирус человека HMPV.
Этот печальный феномен наблюдается уже на протяжении 24 лет, и кроме угрозы численности животных есть шанс, что видоизмененный вирус «вернется» к людям, чья иммунная система уже не будет способна с ним справиться.
Организм, непосредственно передавший вирус человеку, так и не был найден даже в этом исследовании. Янис уверен, что они «не пропустили общего предка», поскольку для подтверждения своих выводов генетики тщательно проанализировали геном других коронавирусов людей, коров, крыс, собак, мышей, индюшек и свиней.
По мнению ученых, это открытие позволит отслеживать изменения в других потенциально опасных для человека коронавирусах, а кроме того, определить природные очаги уже существующих инфекций и их переносчиков.