Первый номер издан 4 ноября 1869 г. английским физиком сэром Джозефом Норманом Локьером, который оставался редактором журнала до 1919 г.
Редактируется Nature Publishing Group в Великобритании, издаётся в Лондоне. Есть филиалы в Нью-Йорке, Сан-Франциско, Вашингтоне, Токио, Париже, Мюнхене и Бэсингстоуке.
Журнал ориентирован на научных работников, но в начале каждого издания публикуется краткое популярное изложение важнейших публикаций. Колонка редактора и раздел «Новости» сообщает о событиях, интересных специалистам разных областей. Публикации в таких журналах, как Nature или Science, крайне престижны, так как лидируют по цитируемости и автор получает широкую известность и за пределами своей области науки.
В 2009 г. вошёл в Список 100 самых влиятельных журналов биологии и медицины за последние 100 лет под №1, был назван Журналом Столетия.
